这一场突击战，玄甲军诸将领是有功有过，方原必须要赏罚分明。
犯了大过的，是福建总兵冯廷。他丢失了淡水城不说，还损失了近八千玄甲军士。这种程度的败仗，已足以导致这次出征台湾之役的失败，论军法，斩了冯廷也是理所当然。
但眼下方原是用人之际，还是留了冯廷一条性命，只是降了他总兵之职，降为校尉，并罚一百军杖。处于战况考虑，方原令他暂代总兵之职，先打五十军杖，余下五十军杖记在账上。战后若不能将功抵过，降职、军杖一并处罚。
冯廷自知这次是疏忽大意，几乎导致全线溃败，方原的惩处不是重了，而是太轻了，只能乖乖的认罚。
纳吉虽有击退郑军偷袭之功，但在大会之时，集结兵力的速度太慢，若不是张英率军前去狙击了郑军一个时辰，玄甲军的防线必然被郑军突破，后果不堪设想。
纳吉是有功有过，功过相当，不奖不罚。
唯一立功的将领，是千户张英，若非他当机立断的据河而守，这一战的胜负还殊未可知。
方原将张英直接从千户提拔成了副总兵，将冯廷残余的万余军士，也调了五千给他，这一次攻打郑森的主力将领，方原已暗中有了人选，就是张英了。
淡水城，在淡水河以北，就是穿越前新北市的北部出海口。
万礼偷袭失败后，率郑军残兵退去淡水城，一则是残军不敢南逃，以免被玄甲军追击，二则是想凭借淡水河防线，继续狙击方原的玄甲军。只要淡水城还在郑军的手中，方原在拔出这个钉子前，绝不敢轻易南下。
方原得到了万礼撤退去淡水城的情报，估算一下，万礼这支一万三千人的郑军，已是郑家最后的家当，只要能歼灭这支郑军，郑森将再无兵可用。
方原亲率一众将领前去淡水河南岸观察了地形，淡水河宽至少三十丈，河对岸就是淡水城，城墙上架设了大量的火炮。他令军士测量了河水，至少三丈深，从淡水河渡河攻打淡水城，损失必然惨重。若是绕行的话，城墙上的火炮仍然是令人头疼的大杀器。
他远眺着对岸的淡水城，万礼想凭借淡水河设防，从排兵布阵来说确实是没有漏洞。但淡水河是有出海口的，换句话说，可以从海上直接将战舰派到淡水城下，以战舰炮轰淡水城。
方原查看地形后，便派出俘虏的十个郑军军士前去淡水城里传话，令主将万礼立刻投降，否则城破之后，所有郑军军士一个不留。
万礼本就抱着必死之心，一眼就看穿了方原派降兵前来的目的。他虽决意死战，但郑军军士可能投降的却不在少数。
万礼根本不令这些降兵进城动摇军心，直接在城门下就将十来个郑军军士尽数射杀，也是向方原表明坚定的决心，淡水城绝不会投降，会死战到底，要攻城尽管来攻。
方原是怒火中烧，既然万礼与回到鸡笼城，开始布置攻陷淡水城的军事任务。
冯廷是主将，张英是副将，攻打淡水城的主力就是一万二千军士。方原、纳吉的八千山地特种营则留守在鸡笼城，一是收编各原住民部族前来支援的战士，一是防止郑森，或是阿美、排湾二族前来偷袭。
施福则率水师舰队，从淡水河直趋淡水城下，炮轰淡水城，掩护攻城的军士。
任务分派完成，各路人马是分队出发，浩浩荡荡的杀向了淡水城。
淡水城之战的激烈却远超方原之前的估计。
万礼为了防备玄甲军战舰从海面来攻，直接往淡水河里倾倒火油，火油顺着水流，延绵一里的淡水河河面上全漂浮着火油。
施福的第一批三艘中型炮舰杀至淡水城下时，万礼直接令城墙上的一百军士抛下火把。
河面上的火油一点燃，立刻火光冲天，将三艘战舰尽数吞噬在一条火龙之中。三艘战舰转眼间就被烧毁，三艘战舰上的一百军士也被活生生的烧死在河面，全军覆没。
初战失利，施福是怒火中烧，再次派出三艘战舰前仆后继的冲向淡水城下，想要强行炮轰轰开淡水城的城门。
万礼令郑军将仅存的火油尽数倾倒在河面，再次点火火烧玄甲军的战舰。经过两日两夜的水面争夺战，施福拼着损失了七艘战舰，两百水手，终于是耗光了淡水城里的火油。
没了火油的火攻，施福的战舰立刻夺取了河面的控制权，四、五艘战舰齐刷刷的开到城下，开始炮轰城墙。
万礼出征之前并没有携带火炮，却在攻占淡水城时，缴获了冯廷丢弃在城内的十门火炮，铅弹、火炮。这十门火炮是大大提升了淡水城的防御力，给施福的战舰造成了极大的威胁。
双方的火炮，一个在战舰上，一个在城头，经过三日三夜的互相炮轰，玄甲军的战舰又损失了三、四艘。
到了第三日，城内的铅弹首先打光，万礼又令军士在城里寻找大小相似的石块打磨圆滑了，代替铅弹使用。
靠着这些石块炮弹，城内又坚持了两日，火药也尽数耗尽。自此，施福的舰队算是彻底掌控了河道，城内再无反击之力。
自开战以来，淡水城的郑军一共摧毁了玄甲军的战舰十二艘，单从战果而论，已是十分辉煌的胜利。但这一战是双方不死不休的攻防战，万礼就是摧毁再多的玄甲军战舰，也改变不了河道丢失的失败。
玄甲军战损的战舰残木漂浮在河面上，已大大的阻碍了运兵船将军士输送到河对